韩文瑜/顾敬敏课题组利用宏基因组学和生物信息学方法，分析揭示了仔猪肠道噬菌体介导的 ARGs 转移的潜在途径和驱动因素。相关研究成果于2022年11月24日以题为《Metagenomics analysis reveals potential pathways and drivers of pigletgut phage-mediated transfer of ARGs》在线发表于国际学术期刊《SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT》。

抗生素耐药病原体的日益流行导致人们更好地了解导致这种扩张的潜在过程。集约化养猪场被认为是抗生素抗性基因 (ARG) 传播的热点之一。噬菌体作为ARGs的重要移动载体，广泛存在于动物肠道中。然而，对猪肠中噬菌体相关 ARG 及其潜在驱动因素的了解有限。因此，课题组分别对健康仔猪和腹泻仔猪不同肠道（回肠、盲肠和粪便）内容物的病毒 DNA 和总 DNA 进行了宏基因组测序和分析。结果表明仔猪盲肠中的噬菌体是 ARG 和移动遗传元件 (MGE) 基因的主要储存库。噬菌体相关的 MGEs 是影响 ARGs 维持和转移的重要因素。有趣的是，ARG 和 MGE 基因在仔猪肠道噬菌体中的共定位似乎不是随机选择的，而是与特定的噬菌体宿主（链球菌）有关。此外，在腹泻仔猪的粪便中，携带ARGs和MGE基因的噬菌体丰度显着增加，同时多价噬菌体（具有广泛宿主范围的噬菌体）的多样性也显着增加，这将促进ARGs在肠道细菌群落中的转染和更广泛分布。重要的是，预测的腹泻粪便中多价噬菌体的宿主谱趋向于潜在的肠道病原菌属，这大大增加了肠病菌获得 ARGs 的风险。该研究极大地扩展了对仔猪肠道微生物组的认识，揭示了仔猪肠道ARGs维持和传播的潜在机制，为畜牧业ARG污染防控提供了参考。

   冀亚路为文章第一作者，该研究得到国家自然科学基金联合基金重点项目的资助。

   论文链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0048969722074046?via%3Dihub

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